Update app.py

app.py

@@ -1,15 +1,11 @@
-
 import streamlit as st
 import numpy as np
 import matplotlib.pyplot as plt
 import random
 from scipy.stats import entropy as scipy_entropy
 import time
-import imageio
 from datetime import datetime
 
-st.set_page_config(layout="wide")
-
 # --- ПАРАМЕТРЫ ---
 seqlen = 60
 min_run, max_run = 1, 2
@@ -17,6 +13,7 @@ ANGLE_MAP = {'A': 60.0, 'C': 180.0, 'G': -60.0, 'T': -180.0, 'N': 0.0}
 bases = ['A', 'C', 'G', 'T']
 
 # --- ФУНКЦИИ ---
+
 def find_local_min_runs(profile, min_run=1, max_run=2):
     result = []
     N = len(profile)
@@ -77,6 +74,15 @@ def compute_entropy(profile):
     p = counts / counts.sum()
     return scipy_entropy(p, base=2)
 
+def compute_global_entropy(seq_history):
+    """
+    Вычисление глобальной энтропии на основе исторических последовательностей.
+    """
+    all_torsions = np.concatenate([np.array([ANGLE_MAP.get(nt, 0.0) for nt in seq]) for seq in seq_history])
+    vals, counts = np.unique(all_torsions, return_counts=True)
+    p = counts / counts.sum()
+    return scipy_entropy(p, base=2)
+
 # --- UI ---
 st.title("🔴 Живой эфир мутаций ДНК")
 start = st.button("▶️ Старт эфира")
@@ -86,6 +92,7 @@ plot_placeholder = st.empty()
 
 if start:
     seq = ''.join(random.choices(bases, k=seqlen))
+    seq_history = [seq]  # История последовательностей для расчета глобальной энтропии
     stat_bist_counts = []
     stat_entropy = []
 
@@ -97,6 +104,7 @@ if start:
 
         if step != 0:
             seq = bio_mutate(seq)
+            seq_history.append(seq)  # Добавляем в историю
 
         torsion_profile = np.array([ANGLE_MAP.get(nt, 0.0) for nt in seq])
         runs = find_local_min_runs(torsion_profile, min_run, max_run)
@@ -105,7 +113,10 @@ if start:
         stat_entropy.append(ent)
         acorr = compute_autocorr(torsion_profile)
 
-        fig, axs = plt.subplots(3, 1, figsize=(10, 8))
+        # Вычисляем глобальную энтропию
+        global_ent = compute_global_entropy(seq_history)
+
+        fig, axs = plt.subplots(4, 1, figsize=(10, 10))
         plt.subplots_adjust(hspace=0.45)
 
         axs[0].plot(torsion_profile, color='royalblue')
@@ -123,6 +134,10 @@ if start:
         axs[2].set_title(f"Автокорреляция / Энтропия: {ent:.2f}")
         axs[2].set_xlabel("Лаг")
 
+        axs[3].plot(stat_entropy, '-o', color='green', markersize=4)
+        axs[3].set_title(f"Глобальная Энтропия: {global_ent:.2f}")
+        axs[3].set_ylabel("Глобальная энтропия")
+
         plot_placeholder.pyplot(fig)
         plt.close(fig)